Ciao, il modo più semplice e veloce per ripartire da zero è quello di cancellare i file swpi.s3db che trovi nella sottocartella /db di /swpi.
Meglio in ogni caso farne una copia per poterli ripristinare in caso di problemi.

Al riavvio successivo swpi dovrebbe ricreare i db puliti.

In realtà ci sarebbe anche uno script per ripulire il db in modo più soft (resetDB.py) ma almeno quando lo provai io tempo fa dava un errore (probabilmente non era ancora aggiornato con la nuova struttura delle tabelle).

per il reset del db interno usate lo.script citato da Alessandro. per lmysql consulta la documentazione si mysql.